在2009年6月开始的第21届亚洲杯电视快棋赛中，孔杰第一轮战胜姜东润，半决赛战胜李昌镐，决赛战胜李世石，孔杰单骑冲阵，连挑韩国三大天王，获得了亚洲杯快棋赛的冠军。孔杰也凭借两次进入世界大赛决赛的经历，从七段升为了九段。

迈过了李世石这个最大难关，孔杰的信心大增，连续战胜韩国姜儒泽、崔哲瀚，半决赛屠龙朴永训，这也是孔杰对朴永训的六连胜，孔杰的决赛对手是李昌镐。

客观的说，这次决赛的孔杰实力的确要强于邱峻，邱峻0-2的落败与其说自己发挥不好，不如说是孔杰有如神助。邱峻经此一役，也有了突破，成为了世界大赛上中国棋手的得利战将。

不过，蛰伏已久的孔杰突然崛起，接过了古力的接力棒。在第21届亚洲杯快棋赛上，孔杰连胜韩国姜东润、李昌镐、李世石三大高手夺得亚洲杯冠军。但这仅仅是开始，从2009年下半年到2010年上半年，孔杰九段连夺三星杯、LG杯、富士通杯三个世界冠军，以及两届亚洲杯，可谓横扫世界棋坛。

2009年9月，第14届三星杯开赛，这次三星杯比赛第一次采用了“双败淘汰”的赛制。第一轮，孔杰战胜了韩国黑马李元怜，但却输给了同组的李昌镐，即便是34岁，李昌镐依然是横亘在中国棋手面前的一座大山。孔杰再次战胜李元怜，顺利杀入十六强，十六强中，孔杰战胜山下敬吾，八强赛中战胜朴永训，半决赛2：0战胜古力，孔杰再次进入世界大赛决赛。

2009年1月，十年沉寂的孔杰终于实现了职业生涯的突破，杀进了第13届三星杯决赛，但结果却是李世石2:0零封孔杰。和古力并称为中国围棋“双子星”的孔杰在李世石面前依然难求一胜。国内围棋爱好者的心情也为之一沉。

本次三星杯决赛前，孔杰对邱峻的成绩大幅领先，各项赛事鏖战近20局，孔杰胜率在七成以上。这也让大家更看好孔杰问鼎。

孔杰的成绩如此骄人，战绩如此显赫，一时间，大家都认为孔杰将会成为新的棋坛王者，和古力共同组成中国的超一流双子星，和李昌镐李世石双雄并峙。

孔杰万万想不到在公司遇到了早年恋人蓝梅，蓝梅依然倾心于他，让他进退两难。蓝梅像落难人在大海中抓住了船帮，死也不会放手了。孔杰心里也十分珍惜这份早年的恋情，只是有一道坎无法迈过，唐莉勤勤恳恳把儿女养大，身体有病还操持着家务，每当中秋节，春节，儿孙们从四面八方归来，一家人热热闹闹围在一起，让孔杰十分高兴。

第三届春兰杯，孔杰再克李昌镐杀进八强，当时他比古力势头更猛，被认为是中国围棋未来的领军者。不过此后孔杰的战绩并没有达到人们的预期，尽管他在国内多项大赛中夺冠，世界大赛中也多次进入八强、四强，但随着古力夺取世界冠军脱颖而出，孔杰还是被拉开了距离。